《矿产资源补偿费征收管理规定》系1994年2月27日国务院令第150号发布，自1994年4月1日起施行。根据1997年7月3日国务院第222号令发布的《国务院关于修改<矿产资源补偿费征收管理规定>的决定》修改。
缴纳程序
一。缴费人应在规定期限内进行纳费申报，填报《矿产资源补偿费纳费申报表》
二。提交已开采矿产品的矿种、产量、销售数量、销售价格和实际开采回采率等各项数据资料。
三。国土资源主管部门按照矿产资源补偿费计征公式对企业提交的纳费申报表审查，并结合采矿企业设计生产能力，实际生产规模
等因素，按照规定核定纳费人的纳费数额。
提交资料
1、已采出的矿产品的矿种；
2、已采出的矿产品的产量；
3、矿产品的销售数量；
4、矿产品的销售价格和实际开采回采率等资料。
征收单位
矿产资源补偿费由所在市国土资源主管部门和区、县级地矿主管部门会同同级财政部门负责征收。中央直属矿山企业、市属国有矿山企业和跨区县矿山企业的补偿费，由市国土资源主管部门负责征收，其它各类矿山企业的补偿费由区县地矿主管部门负责征收。
收费标准
按照《矿产资源补偿费征收管理规定》第五条计算公式计征应征矿补费的额度。矿产资源补偿费收费标准是：征收矿产资源补偿费金额=矿产品销售收入×补偿费费率×开采回采率系数。
费率
以从价法计征资源补偿费，费率按矿种进行分档，大体为矿产品销售收入的1%～4%，平均为1.18%。石油、天然气、煤炭、煤成气、石煤、油砂的费率为1%；黑色金属矿产、有色金属矿产、非金属矿产及天然沥青、油页岩的费率为2%；放射性矿产、稀有金属矿产、稀土金属矿产、稀散元素矿产、气体矿产的费率为3%；贵金属矿产、离子型稀土矿产、宝石、玉石、宝石级金刚石及矿泉水的费率为4%；矿盐的费率为0.5%。<详细:矿产资源补偿费费率表>
我国《矿产资源补偿费征收管理规定》，对外商投资企业和国内不同经济类型的采矿权人适用同一费率和相同征收管理办法。
根据2014年9月26日国务院第64次常务会议决定和财政部、国家税务总局发布的《关于调整原油、天然气资源税有关政策的通知》（财税[2014]73号），明确12月1日起原油、天然气矿产资源补偿费费率降为零，相应将资源税适用税率由5%提高至6%。
使用管理
市级国土资源主管部门负责征收的矿山企业，由纳费人按月填写《矿产资源补偿费纳费申报表》，经市国土资源主管部门审查确认后，按5：5的分成比例，分别解入中央和地方金库。
各区县所负责征收的矿补费按国务院第150号令等规定，填写《市财政缴款书》和《中央矿产资源补偿费专用缴款书》，分2次上缴国库，每年7月1日以前将上半年征收的矿补费按5：5比例分别解入中央和地方金库，下一年度的1月1日前将上年度下半年征收的矿补费按规定分别缴入中央和地方金库。市局监督。
第一条
为了保障和促进矿产资源的勘查、保护、科学规划、合理开发、总体布置，维护国家对矿产资源的财产权益，根据《中华人民共和国矿产资源法》的有关规定，制定本规定。
第二条
在中华人民共和国领域和其他管辖海域开采矿产资源，应当依照本规定缴纳矿产资源补偿费；法律、行政法规另有规定的，从其规定。
第三条
矿产资源补偿费按照矿产品销售收入的一定比例计征。企业缴纳的矿产资源补偿费列入管理费用。 采矿权人对矿产品自行加工的，按照国家规定价格计算销售收入；国家没有规定价格的，按照征收时矿产品的当地市场平均价格计算销售收入。采矿权人向境外销售矿产品的，按照国际市场销售价格计算销售收入。本规定所称矿产品，是指矿产资源经过开采或者采选后，脱离自然赋存状态的产品。
第四条
矿产资源补偿费由采矿权人缴纳。矿产资源补偿费以矿产品销售时使用的货币结算；采矿权人对矿产品自行加工的，以其销售最终产品时使用的货币结算。
第五条
矿产资源补偿费按照下列方式计算：征收矿产资源补偿费金额= 矿产品销售收入×补偿费费率×开采回采率系数
开采回采率系数=核定开采回采率/实际开采回采率
核定开采回采率，以按照国家有关规定经批准的矿山设计为准；按照国家有关规定，只要求有开采方案，不要求有矿山设计的矿山企业，其开采回采率由县级以上地方人民政府负责地质矿产管理工作的部门会同同级有关部门核定。
不能按照本条第一款、第二款规定的方式计算矿产资源补偿费的矿种，由国务院地质矿产主管部门会同国务院财政部门另行制定计算方式。
第六条
矿产资源补偿费依照本规定附录所规定的费率征收。
矿产资源补偿费费率的调整，由国务院财政部门、国务院地质矿产主管部门、国务院计划主管部门共同确定，报国务院批准施行。
第七条
矿产资源补偿费由地质矿产主管部门会同财政部门征收。
矿区在县级行政区域内的，矿产资源补偿费由矿区所在地的县级人民政府负责地质矿产管理工作的部门负责征收。
矿区范围跨县级以上行政区域的，矿产资源补偿费由所涉及行政区域的共同上一级人民政府负责地质矿产管理工作的部门负责征收。
矿区范围跨省级行政区域的和在中华人民共和国领海与其他管辖海域的，矿产资源补偿费由国务院地质矿产主管部门授权的省级人民政府地质矿产主管部门负责征收。
第八条
采矿权人应当于每年的 7月31日前缴纳上半年的矿产资源补偿费；于下一年度1月31 日前缴纳上一年度下半年的矿产资源补偿费。
采矿权人在中止或者终止采矿活动时，应当结缴矿产资源补偿费。
第九条
采矿权人在缴纳矿产资源补偿费时，应当同时提交已采出的矿产品的矿种、产量、销售数量、销售价格和实际开采回采率等资料。
第十条
征收的矿产资源补偿费，应当及时上缴，并按照下款规定的中央与省、自治区、直辖市的分成比例分别入库，年终不再结算。
中央与省、直辖市矿产资源补偿费的分成比例为5∶5;中央与自治区矿产资源补偿费的分成比例为4∶6。
第十一条
矿产资源补偿费纳入国家预算，实行专项管理，主要用于矿产资源勘查。
矿产资源补偿费的具体使用管理办法，由国务院财政部门、国务院地质矿产主管部门、国务院计划主管部门共同制定。
第十二条
采矿权人有下列情形之一的， 经省级人民政府地质矿产主管部门会同同级财政部门批准，可以免缴矿产资源补偿费：
（一)从废石(矸石）中回收矿产品的；
（二）按照国家有关规定经批准开采已关闭矿山的非保安残留矿体的；
（三）国务院地质矿产主管部门会同国务院财政部门认定免缴的其他情形。
第十三条
采矿权人有下列情形之一的，经省级人民政府地质矿产主管部门会同同级财政部门批准，可以减缴矿产资源补偿费：
（一）从尾矿中回收矿产品的；
（二）开采未达到工业品位或者未计算储量的低品位矿产资源的；
（三）依法开采水体下、建筑物下、交通要道下的矿产资源的；
（四）由于执行国家定价而形成政策性亏损的；
（五）国务院地质矿产主管部门会同国务院财政部门认定减缴的其他情形。
采矿权人减缴的矿产资源补偿费超过应当缴纳的矿产资源补偿费50%的，须经省级人民政府批准。
批准减缴矿产资源补偿费的，应当报国务院地质矿产主管部门和国务院财政部门备案。
第十四条
采矿权人在规定期限内未足额缴纳矿产资源补偿费的，由征收机关责令限期缴纳，并从滞纳之日起按日加收滞纳补偿费2‰的滞纳金。采矿权人未按照前款规定缴纳矿产资源补偿费和滞纳金的，由征收机关处以应当缴纳的矿产资源补偿费3 倍以下的罚款；情节严重的，由采矿许可证颁发机关吊销其采矿许可证。
第十五条
采矿权人采取伪报矿种，隐匿产量、销售数量，或者伪报销售价格、实际开采回采率等手段，不缴或者少缴矿产资源补偿费的，由征收机关追缴应当缴纳的矿产资源补偿费，并处以应当缴纳的矿产资源补偿费 5倍以下的罚款；情节严重的，由采矿许可证颁发机关吊销其采矿许可证。
第十六条
采矿权人未按照本规定第九条的规定报送有关资料的，由征收机关责令限期报送；逾期不报送的，处以5000元以下罚款；仍不报送的，采矿许可证颁发机关可以吊销其采矿许可证。
第十七条
依照本规定对采矿权人处以的罚款、加收的滞纳金应当上缴国库。
第十八条
当事人对行政处罚决定不服的，可以自接到处罚决定通知之日起15日内向作出处罚决定的机关的上一级机关申请复议；当事人也可以自接到处罚决定通知之日起15日内直接向人民法院起诉。
当事人逾期不申请复议也不向人民法院起诉、又不履行处罚决定的，作出处罚决定的机关可以申请人民法院强制执行。
第十九条
本规定发布前的地方性法规和地方人民政府发布的规章及行政性文件的`内容，与本规定相抵触的，以本规定为准。
第二十条
省、自治区、直辖市人民政府可以根据本规定制定实施办法。
第二十一条
本规定由地质矿产部负责解释。
第二十二条
本规定自1994年4月1日起施行。